维基百科是由Bomis.com的总裁吉米-威尔士发起的。在此之前，他曾发起过一个虽属自愿创办但却处于严格控制下的百科全书项目Nupedia，主编们都拥有博士学历，但他们只收集了几百篇文章，2年后由于缺乏资金和资源，这个项目流产了。为了不让这些内容浪费掉，2001年1月威尔士将这些文章贴到一个wiki网站上，并且邀请访问者对之做出修改和增添新的内容。这个网站第一年就取得了很大成功，第二年也是如此。
维基百科最初的构想是在拉里-桑格(当时Nupedia主编)和一个电脑程序员Ben Kovitz于2001年1月2日在美国加利福尼亚州的一次谈话中最早提出的。Kovitz当时是wiki程序的协作开发者之一(现在依然是)。当他在晚餐中向桑格解释wiki的概念时，桑格立即发现wiki可能是创建一个更开放的百科全书计划的技术。在此之前几个月，桑格和他的老板威尔士，Bomis, Inc.的总裁兼CEO，讨论过如何通过建立一个更开放、轻松的计划来协助Nupedia的发展。
因此桑格立即说服威尔士在Nupedia中建立一个wiki。Nupedia的第一个wiki于1月10日上线，不过在Nupedia的编写人员中遇到极大阻力。因此，一个新的以“维基百科”(Wikipedia)命名的新计划于1月15日在wikipedia.com正式启动。位于美国加州圣地牙哥的服务器和电缆都由威尔士捐献。
在科技站点Slashdot的三次报道后，维基百科开始受到越来越多的关注，此外Google一天也会带来上千人的新流量。
英文维基百科在2001年2月12日达到1,000页，9月7日达到10,000条条目。在计划的第一年，有超过20,000条条目被创建，平均每月1,500条。2002年8月30日，已经有40,000条条目。成长的速度从计划之初就在平稳增长。
随之而来的就是国际化的维基百科，2001年5月，13个非英语维基百科版本计划开始(包括了阿拉伯语、中文、荷兰语、德语、世界语、法语、希伯来文、意大利语、日语、葡萄牙语、俄语、西班牙语和瑞典语)。到九月，又有三个语言版本加入了维基百科大家族。到了该年度末，挪威语等另外三个语言版本也宣布成立。
2002年2月，由Edgar Enyedy(http://enciclopedia.us.es/wiki.phtml?title=Edgar+Enyedy)领导，非常活跃的西班牙语维基百科突然退出维基百科并建立了他们自己的自由百科(Enciclopedia Libre)(http://enciclopedia.us.es/)；理由是未来可能会有商业广告及失去主要的控制权。同年十月，在维基百科参与者Daniel Mayer(maveric149)及其他参与者试图重新整合两个计划，但是Enciclopedia Libre的参与者投票决定，在维基百科能够提出一个团圆提案之前，反对重新整合。然而，Enciclopedia Libre的用户不排除在未来重新合并的可能性，并且希望继续与维基百科保持联系。这场纷争也引起了关于非英语维基百科版本的角色的广泛讨论，并且直接导致了非英语维基百科的几项重大改革。 也经常有破坏者访问维基百科并大肆破坏该计划，通常这些破坏都很快被修复，但是对英文维基百科首页的不断破坏最终导致首页被“保护”，以确保只有管理员可以对其进行修改。
2002年3月，用户ID24开始在英文维基百科发表许多极左文章，关于他的激烈讨论最终导致严重的人身攻击，吉米-威尔士最后于2002年4月禁止ID24对维基百科进行编辑(但允许继续浏览)。而经常在德国历史相关的文章中发表亲右翼观点，并且导致多次争论的用户「Helga」，则在2002年9月被禁止编辑维基百科。
2002年8月，在吉米-威尔士宣布他将不会在维基百科上刊登商业广告之后不久，维基百科的网址从wikipedia.com变为wikipedia.org。
同年10月， Derek Ramsey(Ram-Man)(
http://www.wikipedia.org/wiki/User%3ARam-Man)使用机器人软件(bot)自动添加有关美国城市的信息。这些文章都是自动从人口普查报告中产生的。同时，类似的程序还用于部分其他议题。
2002年12月，姐妹计划Wiktionary(维基辞典)正式开始；它的宗旨是建立一个所有语言的词典。它与维基百科在同一个服务器上运行，使用同样的软件。
2003年1月，维基百科开始支援TeX数学公式显示，代码由Taw编写。
2003年1月22日，英文维基百科达到了10万条条目的里程碑，并再次被Slashdot报道，两天之後，当时第二大的维基百科，德文维基百科，也达到了1万条条目里程碑。现在在不断增加。
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